九寨沟是中国第一个以保护自然风景为主要目的的自然保护区。由翠海、叠瀑、彩林、烟云、雪峰以及奇异多彩的藏族风情组成多彩景象，实地走进树正沟、日则沟、则查洼沟三条主沟内，观看景区内最宽、最高、最雄伟壮观的三大瀑布；珍珠滩瀑布、诺日朗瀑布、熊猫海瀑布，108个高山湖泊及数十处流泉飞瀑等景观。细细体味“黄山归来不看山，九寨归来不看水”的意境。

在神仙池风景区内，能够看到高山海子、大面积钙化景观和茫茫的原始森林等景观。神仙池在藏语中被称为“嫩恩桑措”，意思是仙女洗浴的地方。 景区内有莲台彩池、双龙池、青龙海、神蛙海、金银滩等景点各具神韵。景区内可以骑马，还可以漂流。景区的海拔高度只有2000多米，相对落差也只有300多米，游客的进入性更加强，特别适合一些有强烈高原反应的游客。

五彩池位于则查洼沟南段，是九寨沟最小、最艳丽的池子，且四季不冻。以秀美多彩纯净通透而闻名，因富含碳酸钙的水中，所以湖水光影斑驳。有阳光的时候时是拍摄的最好时间，在不同的位置和角度，呈现出不同的色彩。五彩池的水来自高处的长海，水中生长着水绵、轮藻、小蕨等水生植物群落，还生长有芦苇、节节草、水灯芯等草本植物。

镜海，因为湖面一平如镜，故得其名。这里是九寨沟看倒影的好地方。每当晨曦初露或朝霞遍染之时，蓝天白云、远山近树，尽纳海底。早9点前和晚5点后无风的时候，是拍摄镜海倒影的最佳时间。镜海紧邻在空谷的下游，湖呈狭长形，长约一公里，为林木所包围。对岸山璧像一座巨大的石屏风。

五花海位于九寨沟三条沟的日则沟中段，孔雀河上游，由于海底的钙华沉积、各种色泽艳丽的藻类以及岸边五彩斑斓的林木倒影，使得五花海呈现出鹅黄、藏青、墨绿、宝蓝等各种颜色，故称“五花海”。乘坐景区环保车可直达五花海。沿着湖畔的栈道缓缓前行，五花海西侧的一段栈道是最佳观赏点之一。平静的湖水倒映着五彩的林木和蓝天白云，非常漂亮。

日则沟是九寨沟风景区中的精华部分，风景线在诺日朗和原始森林之间，全长约18公里。这里景点密集，有镜海、珍珠滩瀑布、珍珠滩、五花海、熊猫海、箭竹海、天鹅海、草海等。在这里，有的海子色彩艳丽，有的原始自然；其间还有落差最大的瀑布、聚宝盆似的滩流，古木参天的原始森林，各个景点都会给你强烈的美感，美得令你激动不已。

诺日朗瀑布位于诺日朗游客中心附近，是中国大型钙化瀑布之一。瀑布宽270米，高24.5米，也是中国最宽的瀑布，众多的影视剧曾在这里取景，包括中央电视台1986年版电视剧《西游记》的片尾就是在这里拍摄的。2017年8月地震被毁现在已经修复开放。在观景台上，瀑布全景尽收眼底，秋季时，瀑布的三百米飞流在秋色、云雾的衬托下，化成了一幕波澜壮阔的画面。

长海是九寨沟最长的一个海子，长达四公里多，呈墨蓝色，“S”形分布。海旁林木茂密，一眼望去，巍巍雪峰，还有典型的冰川景观，都沐浴在蓝天白云之中，壮观奇丽。长海海拔在3000米以上，是沟内海拔最高的海。长海四周没有出水口，水源来自于高山融雪。奇怪的是，长海从不干涸，也不溢堤，因此藏民称之为“装不满，漏不干”的宝葫芦。

树正沟是九寨沟主沟，这里景点很多，包括九寨沟内著名景点：芦苇海、树正群海、火花海、犀牛角和树正瀑布等。九寨沟风景区呈Y字形分布，其中树正沟处于“Y”的下支。全沟长14公里，共有各种海子40余个，约占九寨沟景区全部海子的40%。被誉为九寨沟的缩影，这里有神奇诡秘的海子，多姿多彩的滩流，还有原始磨坊和栈桥点缀其间的群海和气势雄伟的大瀑布。

芦苇海是一个半沼泽湖泊，这里生长着很多芦苇。每年春夏时节，这里满眼碧绿；秋冬之际，芦苇一片金黄；每当芦苇花盛开的时候，到处是鹅绒绒的芦花。芦苇海的海拔已达到2140米，这里的芦苇没有低海拔地芦苇那么高大。在芦苇海中间有一条飘逸的水带，蜿蜒穿行于芦苇海中，把芦苇海平分成两半，这条水带有被称为玉带河。