丽江登科坊客栈最大的特色是保留了原有建筑的传统风格，标准的三坊一照壁四合院，具有典型纳西民居风情，所有的房门都沿用传统的纳西六合门，整个院落只看到木头，木门、木窗、木楼梯、木地板、木玄关、除木屋顶上搭的瓦片外，几乎全部用原木构成了整个建筑，完全是一个木楼阁。
丽江登科坊客栈庭院中央有一个悬空的阁楼，阁楼里有舒适的躺椅和茶台，茶台旁是书架，上面堆满了各种书籍，阁楼四面雕花木窗通透敞亮，可供游客